Basic Information

Symbol
CCNG1
RNA class
mRNA
Alias
Cyclin G1 CCNG Cyclin-G1 Cyclin-G CYCG1
Location (GRCh38)
5:163437569-163448199
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation Mechanical injury analysis Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004060.4
Sequence length
2444.0 nt
GC content
0.3797

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-645.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -692.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 577.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001364015.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2414 nt 0.3766
NM_001364018.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2465 nt 0.3822
NM_001364019.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2173 nt 0.3695
NM_001364020.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2273 nt 0.3819
NM_001364021.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2294 nt 0.3814
NM_001364022.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2204 nt 0.3779
NM_001364023.1 NCBI
AUUCCUCGUUAGGGCAGGCGCGGCCCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGA… 2104 nt 0.3650
NM_004060.4 NCBI
CCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGAUCAGGGCCGAGUUGUCUCGGCGGC… 2444 nt 0.3797
NM_199246.2 NCBI
CCCUUCGGCUCCGAGCUGACCCUGAUCAGGGCCGAGUUGUCUCGGCGGC… 2344 nt 0.3682
Summary

The eukaryotic cell cycle is governed by cyclin-dependent protein kinases (CDKs) whose activities are regulated by cyclins and CDK inhibitors. The protein encoded by this gene is a member of the cyclin family and contains the cyclin box. The encoded protein lacks the protein destabilizing (PEST) sequence that is present in other family members. Transcriptional activation of this gene can be induced by tumor protein p53. Two transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the CCNG1 mRNA was slightly increased at all time points after a 5 psi blast exposure, showed increased expression after 10-11 psi, and exhibited augmented up-regulation at 72 hours following a 14-15 psi blast exposure, indicating its role as a cell cycle and DNA damage marker in blast-induced traumatic brain injury [Balaban et al. DOI:10.1016/j.jneumeth.2016.02.001]. In human forensic research, the CCNG1 mRNA was identified as increasingly expressed with age in a U.S. whole blood RNA-Seq dataset and was included in a list of candidate markers for predicting the chronological age of a biological stain donor [Dørum et al. DOI:10.1016/j.fsigen.2023.102976]. In mice, research showed the CCNG1 was up-regulated in kidney tissue at 8 and 24 hours after 10 Gy whole-body irradiation, and a related cyclin G transcript was also up-regulated in brain tissue at the same time points post-irradiation [Zhao et al. DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-2418].