Basic Information

Symbol
CD151
RNA class
mRNA
Alias
CD151 Molecule (Raph Blood Group) TSPAN24 PETA-3 CD151 Antigen RAPH Platelet-Endothelial Tetraspan Antigen 3 CD151 Antigen (Raph Blood Group) Membrane Glycoprotein SFA-1 Tetraspanin-24 Tspan-24 SFA-1 GP27 Platelet-Endothelial Cell Tetraspan Antigen 3 Platelet Surface Glycoprotein Gp27 Hemidesmosomal Tetraspanin CD151 EBS7 MER2 SFA1
Location (GRCh38)
11:832705-839831
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004357.5
Sequence length
1545.0 nt
GC content
0.6149

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-671.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -696.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 435.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039490.2 NCBI
AUUCUCAGCGCUGGGAGCCGCCGCCCCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCC… 1479 nt 0.6146
NM_004357.5 NCBI
AUUCUCAGCGCUGGGAGCCGCCGCCCCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCC… 1545 nt 0.6149
NM_139029.2 NCBI
AUUCUCAGCGCUGGGAGCCGCCGCCCCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCC… 1541 nt 0.6152
NM_139030.4 NCBI
AUUCUCAGCGCUGGGAGCCGCCGCCCCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCC… 1483 nt 0.6143
Summary

The protein encoded by this gene is a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Most of these members are cell-surface proteins that are characterized by the presence of four hydrophobic domains. The proteins mediate signal transduction events that play a role in the regulation of cell development, activation, growth and motility. This encoded protein is a cell surface glycoprotein that is known to complex with integrins and other transmembrane 4 superfamily proteins. It is involved in cellular processes including cell adhesion and may regulate integrin trafficking and/or function. This protein enhances cell motility, invasion and metastasis of cancer cells. Multiple alternatively spliced transcript variants that encode the same protein have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.