Basic Information

Symbol
CD300LF
RNA class
mRNA
Alias
CD300 Molecule Like Family Member F IGSF13 IREM1 NKIR CLM1 CD300f Immune Receptor Expressed On Myeloid Cells 1 Immunoglobulin Superfamily Member 13 CD300 Antigen-Like Family Member F CMRF35-Like Molecule 1 NK Inhibitory Receptor IREM-1 CLM-1 CD300 Molecule-Like Family Member F CD300 Antigen Like Family Member F Immunoglobin Superfamily Member 13 Inhibitory Receptor IREM1 CD300f Antigen CD300F IgSF13 LMIR3
Location (GRCh38)
17:74694308-74712981
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_139018.5
Sequence length
1709.0 nt
GC content
0.5290

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-609.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -641.39 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 489.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001289082.2 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1770 nt 0.5254
NM_001289083.2 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1755 nt 0.5299
NM_001289084.2 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1754 nt 0.5314
NM_001289085.2 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1883 nt 0.5263
NM_001289086.2 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1905 nt 0.5265
NM_001289087.2 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1686 nt 0.5267
NM_139018.5 NCBI
AGUUUGUUCCUGCUGCCAGGCUCCACUGAGGGGAACGGGGACCUGUCUG… 1709 nt 0.5290
Summary

This gene encodes a member of the CD300 protein family. Members of this family are cell surface glycoproteins with a single IgV-like extracellular domain, and are involved in the regulation of immune response. The encoded protein is an inhibitory receptor. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CD300LF was significantly upregulated (1026.038 and 931.911-fold at 12 hours) in skeletal muscle following an incised injury, as identified through DNA microarray analysis [Gaballah et al. DOI:10.1016/j.forsciint.2016.06.027].