Basic Information

Symbol
CKMT2
RNA class
mRNA
Alias
Creatine Kinase, Mitochondrial 2 SMTCK Creatine Kinase, Mitochondrial 2 (Sarcomeric) Basic-Type Mitochondrial Creatine Kinase Sarcomeric Mitochondrial Creatine Kinase Creatine Kinase S-Type, Mitochondrial EC 2.7.3.2 S-MtCK Mib-CK EC 2.7.3
Location (GRCh38)
5:81233320-81266399
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001099735.2
Sequence length
1476.0 nt
GC content
0.5129

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-508.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -534.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 267.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001099735.2 NCBI
GCAUACACUUCUUGGCUGUGUGCGCUCAGCAGGACGUGGGAGGCUCCGG… 1476 nt 0.5129
NM_001099736.2 NCBI
GCAUACACUUCUUGGCUGUGUGCGCUCAGCAGGACGUGGGAGGCUCCGG… 1480 nt 0.5135
NM_001825.3 NCBI
GCAUACACUUCUUGGCUGUGUGCGCUCAGCAGGACGUGGGAGGCUCCGG… 1640 nt 0.5128
Summary

Mitochondrial creatine kinase (MtCK) is responsible for the transfer of high energy phosphate from mitochondria to the cytosolic carrier, creatine. It belongs to the creatine kinase isoenzyme family. It exists as two isoenzymes, sarcomeric MtCK and ubiquitous MtCK, encoded by separate genes. Mitochondrial creatine kinase occurs in two different oligomeric forms: dimers and octamers, in contrast to the exclusively dimeric cytosolic creatine kinase isoenzymes. Sarcomeric mitochondrial creatine kinase has 80% homology with the coding exons of ubiquitous mitochondrial creatine kinase. This gene contains sequences homologous to several motifs that are shared among some nuclear genes encoding mitochondrial proteins and thus may be essential for the coordinated activation of these genes during mitochondrial biogenesis. Three transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans analyzing 64,510 cardiomyocytes from integrated single-cell datasets identified three distinct subpopulations based on oxidative stress, with the high oxidative stress (HOX) subpopulation exhibiting a unique metabolic-immune signature and central communication role [Hu et al. DOI:10.3390/antiox14121435].