Basic Information

Symbol
DMKN
RNA class
mRNA
Alias
Dermokine ZD52F10 Epidermis-Specific Secreted Protein SK30/SK89 UNQ729
Location (GRCh38)
19:35497220-35513693
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_033317.5
Sequence length
1924.0 nt
GC content
0.5925

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-794.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -827.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 573.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001352328.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 923 nt 0.5504
NM_001352329.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 908 nt 0.5496
NM_001352330.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 924 nt 0.5487
NM_001352331.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 460 nt 0.5435
NM_001352332.2 NCBI
AUUGCGUAGUUCCGAAUACCCUCGGCCACACCUGGCCUUCUCCAUGCUC… 409 nt 0.5379
NM_033317.5 NCBI
GAGAAGCCCAGGCAGUUGAGGACAGGAGAGAGAAGGCUGCAGACCCAGA… 1924 nt 0.5925
Showing 11 to 16 of 16 entries
Summary

This gene is upregulated in inflammatory diseases, and it was first observed as expressed in the differentiated layers of skin. The most interesting aspect of this gene is the differential use of promoters and terminators to generate isoforms with unique cellular distributions and domain components. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in Wistar-albino rats demonstrated that the DMKN exhibits a time-dependent expression pattern following mild traumatic brain injury, with decreased expression at 1 hour post-trauma and a gradual increase thereafter [Colak et al. DOI:10.1016/j.injury.2012.01.021].