Basic Information

Symbol
AFAP1L2
RNA class
mRNA
Alias
Actin Filament Associated Protein 1 Like 2 KIAA1914 XB130 Actin Filament-Associated Protein 1-Like 2 AFAP1-Like Protein 2 Em:AC005383.4 FLJ14564 Actin Filament Associated Protein 1-Like 2 CTB-1144G6.4 CTB-1144G6.6
Location (GRCh38)
10:114293604-114404775
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001001936.3
Sequence length
3722.0 nt
GC content
0.5078

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1249.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1313.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1060.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001351072.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 4016 nt 0.5149
NM_001351073.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3932 nt 0.5135
NM_001351074.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3707 nt 0.5066
NM_001351075.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3473 nt 0.5010
NM_001351076.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3461 nt 0.4999
NM_001351077.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3803 nt 0.5093
NM_001351078.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3794 nt 0.5084
NM_001351079.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3791 nt 0.5083
NM_001351080.2 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3557 nt 0.5030
NM_032550.4 NCBI
AGAGCAGCGCAGAAGCCGAGCCGCGAGGAGCGCACUCCGUGGCCCCGAU… 3710 nt 0.5067
Showing 11 to 20 of 20 entries
Summary

Enables SH2 domain binding activity; SH3 domain binding activity; and protein tyrosine kinase activator activity. Involved in several processes, including positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway; regulation of gene expression; and regulation of mitotic cell cycle. Located in cytosol and plasma membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the AFAP1L2 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].