Basic Information

Symbol
ELAVL4
RNA class
mRNA
Alias
ELAV Like RNA Binding Protein 4 PNEM HUD ELAV (Embryonic Lethal, Abnormal Vision, Drosophila)-Like 4 (Hu Antigen D) ELAV Like Neuron-Specific RNA Binding Protein 4 Paraneoplastic Encephalomyelitis Antigen HuD ELAV-Like Protein 4 Hu Antigen D ELAV (Embryonic Lethal, Abnormal Vision, Drosophila)-Like 4 Hu-Antigen D HuD
Location (GRCh38)
1:50024029-50203772
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001144774.3
Sequence length
3965.0 nt
GC content
0.3695

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-963.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1045.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1117.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001144774.3 NCBI
GAGCCAAUUUCAGCAAGGCUCUGUUCAGUUGUUCUUAUCUACAUCCUAG… 3965 nt 0.3695
NM_001144775.3 NCBI
ACAGUCCAUCUGGACUCUGUGUGGGAAAGCUGGCUGCCGGCGACUGAUG… 3849 nt 0.3733
NM_001144776.3 NCBI
AGUCUGACUUGGAGUUUUGUGCUGUUGCACGUGAAUGCUCUGGAACUGC… 3778 nt 0.3722
NM_001144777.3 NCBI
AGAGCGAGCUAGAGAGCGAGAGCGGUGAGACUCUGCGGACGUCUUCCCG… 3814 nt 0.3812
NM_001294348.2 NCBI
GCUUCCUUCUCUGGGCAGCAGCUCUGUAAGAAGGAAUGUCAGCUUUUAC… 3818 nt 0.3730
NM_001324208.2 NCBI
AGAGCGAGCUAGAGAGCGAGAGCGGUGAGACUCUGCGGACGUCUUCCCG… 3856 nt 0.3838
NM_001324209.2 NCBI
GAGCCAAUUUCAGCAAGGCUCUGUUCAGUUGUUCUUAUCUACAUCCUAG… 4013 nt 0.3695
NM_001324212.2 NCBI
GAGCCAAUUUCAGCAAGGCUCUGUUCAGUUGUUCUUAUCUACAUCCUAG… 4052 nt 0.3702
NM_001324213.2 NCBI
GCUUCCUUCUCUGGGCAGCAGCUCUGUAAGAAGGAAUGUCAGCUUUUAC… 3860 nt 0.3756
NM_001324214.2 NCBI
GCUUCCUUCUCUGGGCAGCAGCUCUGUAAGAAGGAAUGUCAGCUUUUAC… 3905 nt 0.3736
Showing 1 to 10 of 15 entries
Summary

Enables mRNA 3'-UTR AU-rich region binding activity; poly(A) binding activity; and pre-mRNA intronic pyrimidine-rich binding activity. Involved in 3'-UTR-mediated mRNA stabilization; RNA processing; and positive regulation of 3'-UTR-mediated mRNA stabilization. Predicted to be located in axon; cytoplasm; and dendrite. Predicted to be part of ribonucleoprotein complex. Predicted to be active in glutamatergic synapse. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the ELAVL4, a neuronal-specific RNA binding protein, was part of a cluster of genes whose expression was inversely correlated with injury severity following experimental contusive spinal cord injury [De Biase et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00081.2005].