Basic Information

Symbol
EZH2
RNA class
mRNA
Alias
Enhancer Of Zeste 2 Polycomb Repressive Complex 2 Subunit ENX-1 KMT6 KMT6A Histone-Lysine N-Methyltransferase EZH2 Lysine N-Methyltransferase 6 Enhancer Of Zeste Homolog 2 EZH1 Enhancer Of Zeste (Drosophila) Homolog 2 Enhancer Of Zeste Homolog 2 (Drosophila) EC 2.1.1.356 EC 2.1.1.43 EC 2.1.1 EZH2b ENX1 WVS2 WVS
Location (GRCh38)
7:148807257-148884330
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004456.5
Sequence length
2654.0 nt
GC content
0.4491

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-766.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -819.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 553.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001203247.2 NCBI
GUUUGGCGCUCGGUCCGGUCGCGUCCGACACCCGGUGGGACUCAGAAGG… 2639 nt 0.4502
NM_001203248.2 NCBI
GUUUGGCGCUCGGUCCGGUCGCGUCCGACACCCGGUGGGACUCAGAAGG… 2612 nt 0.4483
NM_001203249.2 NCBI
GGAGUAGCUUCGCCUCUGACGUUUCCCCACGACGCACCCCGAAAUCCCC… 2647 nt 0.4439
NM_004456.5 NCBI
GUUUGGCGCUCGGUCCGGUCGCGUCCGACACCCGGUGGGACUCAGAAGG… 2654 nt 0.4491
NM_152998.3 NCBI
GUUUGGCGCUCGGUCCGGUCGCGUCCGACACCCGGUGGGACUCAGAAGG… 2522 nt 0.4516
Summary

This gene encodes a member of the Polycomb-group (PcG) family. PcG family members form multimeric protein complexes, which are involved in maintaining the transcriptional repressive state of genes over successive cell generations. This protein associates with the embryonic ectoderm development protein, the VAV1 oncoprotein, and the X-linked nuclear protein. This protein may play a role in the hematopoietic and central nervous systems. Multiple alternatively splcied transcript variants encoding distinct isoforms have been identified for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2011] CIViC Summary for EZH2 Gene

Forensic Context

A study in human traumatic brain injury (TBI) patients identified the EZH2 as one of the top five downregulated long noncoding RNAs in brain contusion tissues compared to adjacent tissues, with a log2(fold change) of -6.791, and this differential expression was validated by quantitative real-time PCR [Zhang et al. DOI:10.097/WNR.0000000000001756].