Basic Information

Symbol
CD36
RNA class
mRNA
Alias
CD36 Molecule (CD36 Blood Group) GPIIIB GPIV GP3B FAT GP4 Platelet Glycoprotein 4 Fatty Acid Translocase SCARB3 CD36 Antigen (Collagen Type I Receptor, Thrombospondin Receptor) CD36 Molecule (Thrombospondin Receptor) Leukocyte Differentiation Antigen CD36 Platelet Glycoprotein IV Glycoprotein IIIb PAS IV CD36 Molecule (CD36 Blood Group) Transcript Scavenger Receptor Class B, Member 3 Scavenger Receptor Class B Member 3 Platelet Collagen Receptor Thrombospondin Receptor Cluster Determinant 36 PAS-4 Protein CD36 Antigen BDPLT10 CHDS7 PASIV PAS-4
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001001548.3
Sequence length
4598.0 nt
GC content
0.3706

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1162.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1253.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1096.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((((((((...))))))....((((.(((((.........((((..(((((...)))))..))))((((....))))..(((....((((..((((....))))..))))...))).((((((((((.......))...))))))))....................((((((((...((((((..(((.((((((..((((((((..((................))..))))))))....(((((.(((....)))..))))).((((((((.(...(((((..(((((.((((.(((((((((((.((((((((.((.......)).)))))))).)))...(.((((.(((((((....))))))))))).)((((((((((..(((((.((((((((.(((((((......))).))))))))))))....(((((((((.(((((((.(((..(((((......(((((.(((((...((((((((..(((...))).(.(((.(((((.((((((((((((.............(..(((((((..(((...(.(((((((((((......)))))))).))).)...))).)))))))..).(((((((...(((((((((....(((...........)))((((.((..((.(((((..(((((((.........(((........)))..((((((((((((......(((((..........(((((((.((.(((........))).))...)))))))..............(((((....(((((((((...(((((((.((((((...((.(((.(((..........))).))).)))))))).)).........(.((((((....................)))))).)))))).)))))))))...))))).)))))......))..)))))))))).........................((((((.(((((((....(((.....)))....))))))).)))))).)))))))..))))).))..)).)))).....((((((((....(((((.(((((((..((((((..(((.(((((((((.......((.(((...............))).)).....)))))))))......((((((..((((....))))....(((((..........)))))....(((((....)))))..................(((((((....))))))).(((((((((....((((.(((((((((....(((.......)))...))).))))))...))))....)))))))))...........))))))....))))))))).)))))))...)))))))))))))....((((((.......)).))))..................)))))))))...(((....))).((((((..((((....((((.((........)).)))).(((.((......)).))).)))).))))))...)))))))..(((((......((((((((((....(((.(((..((((((.....((.........))..))))))))))))....)).)))).))))........))))))))).))))))))))))).))).)...))))))))..))))).))))).......)))))))))))...(((((((....))))))))))).))))))))))))))..))))))))))....(((....)))((((......))))...........))))).))))))).))))).)))))((((((((((((......((((...((.((((((((((.((((((...((((.(((((...(((((....(((((.....)))))((((.(((((..(((....)))..))))).)))).....(((..((((((.(((((((((((((.(.....).))))))...........)))))))...))))))...))))))))))))).....)))).........((((((..(((........((((((.(((((((.....(((((.(((....((((((.(((((((((((...............)))))))))))((.......))...(((((((...((((((.....))))))..))))))).........(((((.(((((((((((.....((((.(((((...))))).))))..)))).))))))).)))))((((((((((...........(((((((((.....(((......)))...((((((....(((((((.(((((((.((......(((((((((((((((........................)))))))))..(((.......)))..............(((((((((((((.(((....((((((.(((.....((((((((...((((((.........))))))....)))))))).))).))))))...)))..))).)))))..)))))...............(((((......)))))))))))..(((((((..((((((((...))))))))....)))))))..((((((....))))))....(((((.(.(((.(((((.((.........))...)))))))).).)))))....))))))))))))))))..))))))........)))))))))(((..((((((...........))))))..)))...))))))))))..))))))....))).)))))......................(((((((((.((.....))..)))).)))))......))))))).))))))((((.....))))(((((((((((((((((((((((((.(((((((((.....))))))).(((((((((((((.((((.((((((((..((((((((.............((((..(((((.(((.(((((.((.(((((((((.......(((((((...))))))).....)).)))))))(((((((((((((......((((....))))......(((((.(.(.((((((((........)))))))).).)))))).))))))))).))))....)).))))).))).)).)))..)))))))))))).((((....)))))))))))).)))).))))))...)))))))....)))))))).)))).))))..............(((((......))))).)))))))))))......((((..(((((.(..(.(((((.........(((((((((((((.....((....))...))))))))))).)).))))).)))))))..)))))))..))))))((((((((((((....))))))))))))))))))..)))))))))).))..))))....(((((....)))))..)))))).)))))).........).))))))))...((((((.(((..(....)..))).)))))).((((.(((..(...((((((.((((.((............)).)))).)))))).)..)))..))))...)))))).)))..))))))...))))))))((..(((((((((.((((.....(((.((((((((......))))...(((.((((.(((.....(((.(((((((((((((.(((((.(((((..........(((((.((((.......((((((.(((..((.((.(((((.(((((....((((((((.(((((....((((((((.......(((((((......)))))))))).)))))..((((((((......((((((((.((((((((.((((((((((..((((((..((((((....)))))).)))))).((((....))))..))).))...))))))))))))).(((((.(..(((.((((((......................)))))).)))..)))))).((((..((((((..((((((((((.....)))))))))))))))).)))).((.((((((((..((....))..))))))))..)).(((((....))).))(((((...)))))..............))))))))))))))))........................(((((((...(((.((.....((((((.(((......(((....)))((((((....)))))).........))).)))))).....)))))...))))))))))))))))))))(((......))))))))...(((((.....)))))..))))).)).))))).))))))..)))).)))))....)))))))))))))))).........))))).)))))...))).)))).))).)))).)))....)))))))))))))..)).((((((...))))))(((((((((((.........)))))))))))..))))))))))))))).)))......(((.(((.((((((....)))))).))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{{{.((((((((((((...)))))),...((((.(((((.,,.....,{{{{,{(({((.,{{||||||}}}}{{{{,,..}}}}.,,,,,||.{(((..{{{|,..,))}),,)))).}},}},(((((((({{.......))...))))))))...............,,...((((((((.,,((((((..(((.{((((,.{(((,.(((({............{(((((.(((((((((({...,,((((,,.,,||}}..,,.((((.((((((((.(...(((((..(((((.((((.(((((((((((.((((((((.({{,.....)).)))))))).)))...{.((((.(((((((....))))))))))){|,{((((((((..(((((,(((((((({(((((((......))).))))))))))))....{((((((((.((({(((.(((..(((((......(((((.(((((...((((((({..{{(...}}}.{|(((.(((((.(((((((((({{,.......,,...{..(((((((..(((.{.(.(((((((((((......)))))))).))).}.,.))).)))))))..}.(((((((...(((((((((..,,(((.,,........}}|,,{{.{{,,((.{((((.,(((((((.,,,,,...{||||.,,.,{{{|{{((((((((((,,......{{{{{..........(((((((.{{.(((........))).}}...)))))))......,,,....,(((({....{({{{{{{{,,,{{{{{{{.((((((.,,({,(((.(((..........))).))),)))))))).}}..{{{...,|,||{(((..,{...........,,}..)}}}}},})}}}}.}}}}}}}}|,..}}))},))))}......}}..})))))))),.{{{{{{.....,{{|||...,{{.((((((.(((((((....(((.....))).,..))))))).)))))).},})))}..)))))}))}}))})))....}}||||||{{,,,,|||||,|||{{||}}||{(((,{(((.,{{{{,{{{{{{{..{(({(((...{{{,...,,...||},||{.,{{||,}}}}|,{{{{{{(({(({..((((....))))....,{(({......,{{{}|||,...}|||||}...|||,.......,,,.........(((((((....))))))).{((((((((....((((.(((((((((....(((.......)))...))).))))))...))))..,.))))))))}.,,...,...,))}}|}....,,}}},}}}.}))))))}}.}}}}}))))}}))}}..|{{{{{..,,,,,)),))))...},,,,,||}}},...)))))))))...(((....))).{{((({.,{{{.....{{|,,|,......,,}}}}}}|.(((.{(......)).))).,}},.))))))...)))))))|.((({,,|,{{,((((({{{({....{{,{(((..((((((.....{{.........}}..))))))))))}}....)).)))),)))).}},}}}}}}}}}))))}}}))))))))))).)}}.),,.})))))))..))))).))))).......)))))))))))..,(((((({....})))))))))).)))))))))))))).,))))))))))}...{{{....}},((((......))))...........))))).))))))).))))).))))}(((((({(((({......{((({,.{(.((((((((((.((((((...{{,,.(((({...(((((....(((((.....))))){(((.{{{{{,,{{{,,,,}}}..|}}|}.}}||,,,,{((,{{(((,,,...|||||((((((.(.....).))))))...........}))))))},.}},))),,,))))))))))))).,,{{|}}}..}}},...((((((..{{{,,.,....{{{(((,{({{{{,.....{({{{.{{{,,..,{{{||.(((((((((((...............))))))))))){(.......||{,,((((((({..((((((.....))))))..|||||||{{{.{{{.,(((((.(((((((((((,{{..((((.(((((...))))).)))),})))),})))))),)))))((((((((((...........(((((((({.....{({......}}}...((((((....(((((((.(((((((.{,......(((((((((((((((...,......,{{,.....))}}.))))))))}..{|,.......,}|..............((((((((((,{{...((({...(((({{(({..,,...||..}})}..})))}...)))).,,,,((((((({..((({......)))).}))))))).,}.)))))..))))).......,,{{,.,,{(({{......)))))))}))}..(((((((((((((((((...))))))))})).)))))))..((((((....))))))....(((((.(.(((.(((((.{(,........))...)))))))).).)))))....}}))))))))))))))..))))))..}.....)))))))))(((..((((((...........))))))..)))...))))))))))..}}}}||{,,,|||.,,)))}},}}...,........,,,,{,{((..,,,.,|.,}}}))..,}))),))))}}}}}}))))))),))}}))||{|,....))))(((((((((((((((((((((({{{{({(((((((.....))))))).(((((((((((((.((((.((((((((..{(((((((.............((((..(((,.,,(({(((((.((.((((({(({,...,,.{{((({,...})))))}.,...}),))))))}((({(((((((((......((((....))))......{{{((.{.,.((((((((........)))))))).}.}))))).))))))))).)))}....)).))))}.))).,..)))..)))))))))))}.((((....)))))))))))).)))).})))))...)))))))....}))))))).)))).)))),,,,,.,,,..,,.{{{{|,.....))))).))))))))))),,,...(((({.(({((.{..(.(((({.........{{(((((((((((..,..({...,},.,.))))))))))).)).))))).)}))))).,))))}))}})))))}((((((((((((....))))))))))))))))))..)))))))))).)),}))},....(((((....)))))..)))))).)))))).........).))))))))...)))).},)}}},,,.,,)))))))..)))).)))))}.....,..((((((.((((.((............)).)))).))))))...}))))...,.)}))))))}.)))..)))))).,,)))))))){{..((((((((,{((((.....(((.(((({(({,.....}))}...(((.((((.(((.....(((.(((((((((((({,(((((.(((((..........(((((.(,,({{{{...((((((.(((..((.{{.(((((.(((((....((((((((((((((,...{{({{{({......{(((((((......)))))))),}.}}}}}..(((((({,....,{((((((((.((((((((,{((((((,((.,((((((..((((({....}))))).)))))),||||,}..||||,,||}.,}...}})}))))))))}.(((((.(..(((.((((((..,.................,.)))))).)))..)))))).((((..((((((..((((((((((.....)))))))))))))))).)))).((.((((((((.,{(....}}.}))))))))..)).{{(((....))).))(((((...)))))..............)))))))))))))))).,........,....||.....,,{((((((...(((.{{.....((((((.(((,...,,(({....}}}((((((....))))))..,,.....))).)))))).....}))))...))))))))))))))))))))(((......))))))))...(((((.....)))))..))))).}}.))))).)))))).,)))).)))))....)))))))))))))))}........,))))).))))).,,))).)))).))).)))).)))....)))))))))))))..}}.((((((...))))))(((((((((((.........)))))))))))}.)))))))))}))))).}},......(((.(((.((((({....}))))).))).))}..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
CUUUCAAUUCCUCUGGCAACAAACCACACACUGGGAUCUGACACUGUAG… 2108 nt 0.3786
AGAUGUCAGGAUAACCUUAAGGAUAGAUGAAGGGUUGAGAGCCUGUGCC… 2048 nt 0.3828
AGGACUGCAGUGUAGGACUUUCCUGCAGAAUACCAUUUGAUCCUAUUAA… 4598 nt 0.3706
ACAUUCUGUUCGCAGGAGAGCUCCAGAAGGGGUGUGGAAGGUUGUGUUG… 1892 nt 0.3842
AUGACAUUAUUAGUUCUGCCACUGGUAGGCAUUAGAAGCAAGAAAAGGG… 1987 nt 0.3749
ACCAGAGCUUGUAGAAACCACUUUAAUCAUAUCCAGGAGUUUGCAAGAA… 1665 nt 0.3742
CUUUCCAAUGAUUAGACGAAUUGAUUCUUUCUGUGACUCAUCAGUUCAU… 1693 nt 0.3745
AGAUGUCAGGAUAACCUUAAGGAUAGAUGAAGGGUUGAGAGCCUGUGCC… 1745 nt 0.3771
AGAUGUCAGGAUAACCUUAAGGAUAGAUGAAGGGUUGAGAGCCUGUGCC… 2044 nt 0.3831
AGAUGUCAGGAUAACCUUAAGGAUAGAUGAAGGGUUGAGAGCCUGUGCC… 4666 nt 0.3746
Showing 1 to 10 of 15 entries
Summary

The protein encoded by this gene is the fourth major glycoprotein of the platelet surface and serves as a receptor for thrombospondin in platelets and various cell lines. Since thrombospondins are widely distributed proteins involved in a variety of adhesive processes, this protein may have important functions as a cell adhesion molecule. It binds to collagen, thrombospondin, anionic phospholipids and oxidized LDL. It directly mediates cytoadherence of Plasmodium falciparum parasitized erythrocytes and it binds long chain fatty acids and may function in the transport and/or as a regulator of fatty acid transport. Mutations in this gene cause platelet glycoprotein deficiency. Multiple alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2014]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the CD36 is a marker for capillary endothelial cells involved in trans-endothelial lipid processing within brown adipose tissue [Behrens et al. DOI:10.1016/j.molmet.2025.102252]. In human skin, the CD36 was identified as a scavenger receptor marker expressed in an immune cell cluster within wound-edge tissues [Liu et al. DOI:10.1016/j.stem.2024.11.013]. A study in rats demonstrated that the CD36 was significantly down-regulated in liver tissue on day 2 following a 20% total body surface area burn injury, indicating its role in altered lipid catabolism during the metabolic response to trauma [Jayaraman et al. DOI:10.1016/j.jss.2007.05.025]. In a separate investigation in mice, the CD36 was identified as over-expressed in liver tissue following Kupffer cell-specific, endothelial cell-specific, and neutron exposures to radiation, as noted in comparative analyses with other hepatotoxicants [Roudkenar et al. DOI:10.1269/jrr.07078].