Basic Information

Symbol
CD79B
RNA class
mRNA
Alias
CD79b Molecule Ig-Beta B29 B-Cell Antigen Receptor Complex-Associated Protein Beta Chain Igbeta IGB CD79B Antigen (Immunoglobulin-Associated Beta) CD79b Molecule, Immunoglobulin-Associated Beta Immunoglobulin-Associated B29 Protein B-Cell-Specific Glycoprotein B29 CD79b Antigen AGM6
Location (GRCh38)
17:63928738-63932629
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000626.4
Sequence length
1246.0 nt
GC content
0.5979

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-519.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -541.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 259.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000626.4 NCBI
AGUUACACGUUUUCCUCCAAGGAGCCUCGGACGUUGUCACGGGUUUGGG… 1246 nt 0.5979
NM_001039933.3 NCBI
AGUUACACGUUUUCCUCCAAGGAGCCUCGGACGUUGUCACGGGUUUGGG… 1249 nt 0.5981
NM_001329050.2 NCBI
AGUUACACGUUUUCCUCCAAGGAGCCUCGGACGUUGUCACGGGUUUGGG… 937 nt 0.6083
NM_021602.4 NCBI
AGUUACACGUUUUCCUCCAAGGAGCCUCGGACGUUGUCACGGGUUUGGG… 934 nt 0.6081
Summary

The B lymphocyte antigen receptor is a multimeric complex that includes the antigen-specific component, surface immunoglobulin (Ig). Surface Ig non-covalently associates with two other proteins, Ig-alpha and Ig-beta, which are necessary for expression and function of the B-cell antigen receptor. This gene encodes the Ig-beta protein of the B-cell antigen component. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for CD79B Gene

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the CD79B was part of a validated 13-gene prediction model (HF.Sig) derived from peripheral blood mononuclear cells that could accurately distinguish between post-myocardial infarction heart failure and non-heart failure patients, achieving an area under the curve of 1 in a validation cohort [Sun et al. DOI:10.3389/fimmu.2023.1163350].