Basic Information

Symbol
CD9
RNA class
mRNA
Alias
CD9 Molecule TSPAN29 MRP-1 Tetraspanin-29 MIC3 P24 Cell Growth-Inhibiting Gene 2 Protein Motility Related Protein-1 Leukocyte Antigen MIC3 CD9 Antigen (P24) CD9 Antigen 5H9 Antigen BA2 Motility-Related Protein BA-2/P24 Antigen Antigen CD9 TSPAN-29 Tspan-29 DRAP-27 BTCC-1
Location (GRCh38)
12:6199715-6238271
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Postmortem interval inference Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001769.4
Sequence length
1225.0 nt
GC content
0.4506

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-378.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -400.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 287.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330312.2 NCBI
ACUCUGGCAGCAGGCCUUGGCCAAGGGGCCUUUAGCCCUGACGACCCGG… 1186 nt 0.4528
NM_001413241.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1306 nt 0.4617
NM_001413242.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1294 nt 0.4505
NM_001413243.1 NCBI
ACUCUGGCAGCAGGCCUUGGCCAAGGGGCCUUUAGCCCUGACGACCCGG… 1330 nt 0.4707
NM_001413244.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1222 nt 0.4501
NM_001413245.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1219 nt 0.4504
NM_001413246.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1216 nt 0.4515
NM_001413247.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1207 nt 0.4507
NM_001413248.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1171 nt 0.4458
NM_001413249.1 NCBI
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCG… 1331 nt 0.4583
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

This gene encodes a member of the transmembrane 4 superfamily, also known as the tetraspanin family. Tetraspanins are cell surface glycoproteins with four transmembrane domains that form multimeric complexes with other cell surface proteins. The encoded protein functions in many cellular processes including differentiation, adhesion, and signal transduction, and expression of this gene plays a critical role in the suppression of cancer cell motility and metastasis. [provided by RefSeq, Jan 2011]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that exosomes and the CD9 are well-preserved in post-mortem body fluids, with no significant difference in the CD9 expression between exosomes from healthy donors and dead bodies, and its expression was sustained over 48 hours under simulated post-mortem conditions [Kim et al. DOI:10.3390/diagnostics12092153]. Another study in humans found that the CD9 expression was significantly lower in menstrual blood-derived mesenchymal stem cells from endometriosis patients compared to those from healthy women [Sahraei et al. DOI:10.1155/2022/7053521].