Basic Information

Symbol
ELP6
RNA class
mRNA
Alias
Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 6 C3orf75 TMEM103 Angiotonin-Transactivated Protein 1 Elongator Complex Protein 6 Transmembrane Protein 103 FLJ20211 Elongator Complex Protein 6 Homolog Chromosome 3 Open Reading Frame 75 UPF0405 Protein C3orf75 Protein TMEM103 ATP1
Location (GRCh38)
3:47495640-47513712
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001031703.3
Sequence length
1352.0 nt
GC content
0.5451

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-521.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -542.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 470.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001031703.3 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1352 nt 0.5451
NM_001363957.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1530 nt 0.5399
NM_001424210.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1376 nt 0.5436
NM_001424211.1 NCBI
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCG… 1324 nt 0.5310
NM_001424212.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1586 nt 0.5322
NM_001424213.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1355 nt 0.5321
NM_001424214.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1331 nt 0.5402
NM_001424215.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1205 nt 0.5402
NM_001424216.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1281 nt 0.5488
NM_001424217.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1459 nt 0.5428
Showing 1 to 10 of 23 entries
Summary

Predicted to be involved in positive regulation of cell migration. Predicted to act upstream of or within several processes, including autophagosome maturation; gene expression; and homeostasis of number of retina cells. Located in cytosol and nucleus. Part of elongator holoenzyme complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ELP6 mRNA exhibited differential binding to the RNA-binding protein hnRNP H1 and changes in gene expression in the striatum in response to methamphetamine administration [Ruan et al. DOI:10.1016/J.Pnpbp.2025.111598].