Basic Information

Symbol
ELP6
RNA class
mRNA
Alias
Elongator Acetyltransferase Complex Subunit 6 C3orf75 TMEM103 Angiotonin-Transactivated Protein 1 Elongator Complex Protein 6 Transmembrane Protein 103 FLJ20211 Elongator Complex Protein 6 Homolog Chromosome 3 Open Reading Frame 75 UPF0405 Protein C3orf75 Protein TMEM103 ATP1
Location (GRCh38)
3:47495640-47513712
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001031703.3
Sequence length
1352.0 nt
GC content
0.5451

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-521.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -542.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 470.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001424218.1 NCBI
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCG… 1197 nt 0.5439
NM_001424219.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1202 nt 0.5549
NM_001424220.1 NCBI
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCG… 1268 nt 0.5402
NM_001424222.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1459 nt 0.5449
NM_001424223.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1738 nt 0.5495
NM_001424224.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1299 nt 0.5412
NM_001424225.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1387 nt 0.5422
NM_001424226.1 NCBI
GUAGUCCGCAGAGGAUCGACCCGGGGAUUGGACUGGAGGCUUGGGCCCG… 1375 nt 0.5404
NM_001424227.1 NCBI
GCCAUCUCGCAUAUUCUCAACGGCUGUGCGUGUCCUUAAAAGUCCCUGG… 1886 nt 0.5477
NM_001424228.1 NCBI
GGCAUUGCGCAUGCGCGCUUCCUUGCGCGAGCCGGGCUGUCGGGUGUGU… 1134 nt 0.5441
Showing 11 to 20 of 23 entries
Summary

Predicted to be involved in positive regulation of cell migration. Predicted to act upstream of or within several processes, including autophagosome maturation; gene expression; and homeostasis of number of retina cells. Located in cytosol and nucleus. Part of elongator holoenzyme complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the ELP6 mRNA exhibited differential binding to the RNA-binding protein hnRNP H1 and changes in gene expression in the striatum in response to methamphetamine administration [Ruan et al. DOI:10.1016/J.Pnpbp.2025.111598].