Basic Information

Symbol
ANAPC10
RNA class
mRNA
Alias
Anaphase Promoting Complex Subunit 10 APC10 DOC1 Anaphase-Promoting Complex Subunit 10 Cyclosome Subunit 10 DKFZP564L0562
Location (GRCh38)
4:144831908-145098823
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001256706.2
Sequence length
1444.0 nt
GC content
0.3386

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-319.75 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -353.41 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 364.89
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256706.2 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1444 nt 0.3386
NM_001256707.2 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1517 nt 0.3434
NM_001256708.2 NCBI
AGUUCCAGCUGUCCCGCAGGAACCGCUGCCACGCGCUGCUGCUGUCUCC… 1703 nt 0.3817
NM_001256709.2 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1585 nt 0.3470
NM_001256710.2 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1482 nt 0.3421
NM_001256711.2 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1555 nt 0.3466
NM_001256712.2 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1312 nt 0.3377
NM_001318367.2 NCBI
UUUUUCACAUAUGAAUAGACUUAGUAAAAUUAACAAAAGAUGUGAAAGA… 1505 nt 0.3243
NM_014885.5 NCBI
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAG… 1433 nt 0.3378
Summary

ANAPC10 is a core subunit of the anaphase-promoting complex (APC), or cyclosome, a ubiquitin protein ligase that is essential for progression through the cell cycle. APC initiates sister chromatid separation by ubiquitinating the anaphase inhibitor securin (PTTG1; MIM 604147) and triggers exit from mitosis by ubiquitinating cyclin B (CCNB1; MIM 123836), the activating subunit of cyclin-dependent kinase-1 (CDK1; MIM 116940) (summary by Wendt et al., 2001 [PubMed 11524682]).[supplied by OMIM, Feb 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the ANAPC10 in microglia, as part of a broader disruption of the ubiquitin-mediated proteolysis pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].